Mateřídouška citronová je kříženec mateřídoušky vejčité (polejovité) a tymiánu obecného a její listy mají vysloveně citronovou chuť. Proto je oblíbená do salátů, a to především do ovocných. Mateřídouška citronová obsahuje téměř stejné látky jako tymián obecný a může se používat ke stejným účelůmjako Thymus vulgaris.

Z křížení bylo získáno velké množství kultivarů s dekorativními listy. Thymus × citriodorus ‘Aureus’ má zlatožlutý list, který je nejkrásnější v zimě a časně na jaře. Později v sezoně postupně zelená, a jak rostlina stárne, žlutá barva se stále více a více vytrácí. Thymus × citriodorus ‘Silver Queen’ má stálejší barvu. Okraje lístků jsou olemovány stříbřitě bílým okrajem.